造成袋式除塵器運行出現問題的因素有很多，除了除塵器自身因素外，操作、管理不當也是造成其在運行中出現問題的重要原因。
1.高溫煙氣對濾袋的損壞
高溫對濾袋的損害是致命的。除了高溫燒毀外，煙氣中的火星對濾袋的損害也是嚴重的。如焦爐、干燥窯、鏈條爐、沖天爐、電爐、高爐、混鐵爐等在生產過程中會有大量的火星混入煙氣中。
高溫煙氣對濾袋的另外一種損害是高溫收縮，雖然每種濾料的使用溫度不同，但當煙氣溫度超過其使用溫度后，如果濾袋緯向熱收縮過大，將使濾袋在徑向尺寸變小，濾袋會緊緊箍在骨架上，甚至無法抽出骨架。
2.濾袋腐蝕
腐蝕是濾袋損壞的常見的原因之一，由于煙氣中含有多種腐蝕性物質，且在高溫環境下腐蝕作用更大，從而會造成濾袋損壞。產生腐蝕的主要原因有水解、氧化、酸、堿腐蝕。其中主要以水解、氧化原因造成損壞較多，而酸腐蝕較少，堿腐蝕則更少。
3.濾袋問題
袋式除塵器的進步主要表現在濾料的創新和清灰方式的變革上，而濾袋又是袋式除塵器的心臟，濾袋的維修費用在除塵器維修費用中所占比例是很高的，有時可達維修費用的70%以上。濾袋是決定除塵器性能的關鍵因素。